bruce Anane
Une nouvelle étude montre l’isolement et le séquençage de plus d’un siècle de molécules d’ARN provenant d’un spécimen de tigre de Tasmanie conservé à température ambiante dans une collection de musée. Cela a conduit pour la première fois à la reconstruction des transcriptomes de la peau et des muscles squelettiques d’une espèce disparue. Les chercheurs soulignent que leurs découvertes ont des implications pertinentes pour les efforts internationaux visant à ressusciter des espèces disparues, notamment le tigre de Tasmanie et le mammouth laineux, ainsi que pour l’étude des virus pandémiques à ARN.
Le tigre de Tasmanie, également connu sous le nom de thylacine, était un marsupial carnivore apical remarquable qui était autrefois répandu sur tout le continent australien et sur l’île de Tasmanie. Cette espèce extraordinaire a connu sa disparition définitive après la colonisation européenne, lorsqu’elle a été déclarée nuisible à l’agriculture et qu’en 1888, une prime de 1 £ a été fixée pour chaque animal adulte tué. Le dernier tigre de Tasmanie vivant connu est mort en captivité en 1936 au zoo de Beaumaris à Hobart, en Tasmanie.
Les efforts d’extinction se sont concentrés sur le tigre de Tasmanie
Les récents efforts de désextinction se sont concentrés sur le tigre de Tasmanie, car son habitat naturel en Tasmanie est encore largement préservé, et sa réintroduction pourrait aider à restaurer les équilibres passés de l’écosystème perdus après sa disparition définitive. Cependant, la reconstruction d’un tigre de Tasmanie vivant et fonctionnel nécessite non seulement une connaissance complète de son génome (ADN), mais également de la dynamique d’expression génique spécifique aux tissus et du fonctionnement de la régulation génique, ce qui ne peut être obtenu qu’en étudiant son transcriptome (ARN). .
« Revivre le tigre de Tasmanie ou le mammouth laineux n’est pas une tâche anodine et nécessitera une connaissance approfondie du génome et de la régulation du transcriptome de ces espèces renommées, ce qui commence seulement à être révélé », explique Emilio Mármol, l’auteur principal de l’ouvrage. une étude récemment publiée dans la revue Genome Research par des chercheurs de SciLifeLab en collaboration avec le Centre de Paléogénétique*, une coentreprise entre le Musée suédois d’histoire naturelle et l’Université de Stockholm
Molécules d’ARN récupérées sur le tigre de Tasmanie
Les chercheurs à l’origine de cette étude ont séquencé, pour la première fois, le transcriptome de la peau et des tissus musculaires squelettiques d’un spécimen de tigre de Tasmanie desséché âgé de 130 ans, conservé à température ambiante au Musée suédois d’histoire naturelle de Stockholm. Cela a conduit à l’identification de signatures d’expression génique spécifiques aux tissus qui ressemblent à celles des mammifères marsupiaux et placentaires existants.
Les transcriptomes récupérés étaient d’une telle qualité qu’il a été possible d’identifier des ARN codant pour des protéines spécifiques du muscle et de la peau et ont conduit à l’annotation des gènes manquants d’ARN ribosomal et de microARN, ces derniers suivant les recommandations de MirGeneDB.
« C’est la première fois que nous pouvons entrevoir l’existence de gènes régulateurs spécifiques du thylacine, tels que les microARN, qui ont disparu il y a plus d’un siècle », explique Marc R. Friedländer, professeur agrégé au Département de biosciences moléculaires du Wenner- Gren Institute de l’Université de Stockholm et SciLifeLab.
Vastes collections de spécimens et de textiles dans les musées
Cette étude pionnière ouvre de nouvelles opportunités et implications passionnantes pour l’exploration des vastes collections de spécimens et de tissus conservés dans les musées du monde entier, où les molécules d’ARN attendent peut-être d’être découvertes et séquencées.
« À l’avenir, nous pourrons peut-être récupérer l’ARN non seulement d’animaux disparus, mais également des génomes de virus à ARN tels que le SRAS-CoV2 et leurs précurseurs évolutifs à partir de la peau de chauves-souris et d’autres organismes hôtes conservés dans les collections des musées », dit-il. J’adore Dalén. , professeur de génomique évolutive à l’Université de Stockholm et au Centre de paléogénétique.
Les auteurs de l’étude se disent enthousiasmés par les développements futurs de la recherche holistique intégrant à la fois la génomique et la transcriptomique vers une nouvelle ère de la paléogénétique au-delà de l’ADN.
Article original: ARN récupéré pour la première fois sur une espèce disparue
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